Останутся ли в базе данных какие-либо остаточные файлы после удаления плагина?

Похоже, что заметки пользователей используют магазин плагинов и пользовательские поля. Чтобы удалить их, нужно посмотреть исходный код и узнать ключи, используемые для каждого из них. Если вам неудобно делать это самостоятельно, можно задать вопрос в канале Marketplace. Я предполагаю, что это займёт у меня от 30 до 120 минут.

Они не занимают много места и никак не могут навредить. Большинство людей не беспокоятся по поводу этой проблемы.