Finalmente, entendi. Era a primeira vez que eu usava subcategorias. Eu havia movido tópicos da categoria principal para a subcategoria e achava que a categoria principal exibia apenas seus próprios tópicos, e não os das subcategorias. Daí os tópicos duplicados entre a subcategoria e a categoria principal.
Então, no final, não vejo muito sentido nas subcategorias, pois poderíamos simplesmente adicionar uma etiqueta (que representa uma subcategoria) aos tópicos relevantes e, depois, filtrar para encontrá-los. Eu pensava que a categoria principal exibia apenas seus próprios tópicos e não os das subcategorias.