Действительно, у меня нет ни малейшего представления о том, что вы хотите сделать. Мне казалось, что я понимаю, но всё становится всё более запутанным.
Вы хотите «начать с чистого листа», но при этом получить «облегчённую» версию. Вы хотите, чтобы его было легко собирать на любом дистрибутиве, и одновременно сделать его проще. И вы ссылаетесь на статью, которая говорит о том, насколько сложно развёртывать приложения на Linux Desktop, обсуждая время запуска и графические драйверы, что, по моему мнению, выглядит совершенно нерелевантным.
На данный момент я придерживаюсь своего первого ответа (который, к сожалению, пока был проигнорирован):
и то, что говорит @pfaffman, действительно очень верно: