Acabo de intentar probar esto con Discourse versión 2.9.0.beta2 y no pude reproducir el problema. Un tema fijado en una categoría incluida en Docs parece estar fijado correctamente en la página docs, como se esperaba.
Este problema podría estar relacionado solo con la versión de Discourse: 2.8.1, y podrías intentar actualizar Discourse para resolverlo.
Versión del plugin Docs: 0.1