Плагин документации — индексная тема не работает после восстановления

По моим воспоминаниям того времени — это не могло быть миграцией. Миграции в идеале не должны затрагивать код приложения (поскольку код может измениться с момента планирования миграции и вызвать ошибку).

PR также указывает причину:

Этот PR также включает rake-задачу (doc_categories.rake) для перестроения разделов боковой панели и ссылок из активных тем индекса документации — это не рекомендуется делать в рамках миграции, так как это потребует использования либо парсера, либо Nokogiri (реализации которых могут измениться и привести к некорректной миграции).