Я уверен, что нужно уничтожить и запустить заново, чтобы применить переменные окружения к контейнеру.
Конечно, если они выполняли обновления через Docker Manager, эти изменения будут утеряны при уничтожении контейнера, поэтому пересборка — наиболее безопасная рекомендация. Возможно, лучше рекомендовать пересборку, так как это самый надёжный способ.