Она есть, если вы хотите задать ссылке собственный заголовок, а не полагаться на тот, который будет выведен из целевого URL, то есть [заголовок](url). Присвоение ссылке заголовка не указывает на предпочтение переписывания URL, поэтому я согласен с @mattmccutchen, что варианты 1 и 2 должны вести себя одинаково в отношении переписывания URL.
Можно привести аргумент, что полное совпадение заголовка с URL служит указанием на то, что его не следует переписывать, но что, если пользователь хочет указать заголовок и при этом не хочет переписывать URL? Должен существовать какой-то другой способ это указать.
В голову приходит идея добавить суффикс к заголовку, аналогичный размеру встроенного изображения, хотя я не уверен, как пользователь сможет узнать об этом.
Встроенное изображение можно изменить в размере следующим образом:

Таким образом, плагин discourse-github мог бы (предположительно) быть настроен на поиск чего-то подобного:
[заголовок|github-no-rewrite](url)