Обработка прозрачных изображений в тёмной теме

При просмотре в тёмной теме прозрачные изображения отображаются не очень хорошо.
Существует ли разметка для установки цвета фона изображения или другой способ решения этой проблемы?

Это не имеет прямого отношения к темам. Возьмите изображение с правильно заданной прозрачностью (альфа-смешение, а не жёстко заданное) или меняйте изображения в зависимости от темы.

Например, логотип Discourse приходится вручную инвертировать для работы в тёмной теме: чёрный цвет заменяется на белый, а остальные цвета остаются без изменений.

Если речь идет об изображениях в постах, вы можете задать цвет фона через CSS в настройках вашей темы.
Например:

.cooked img {
    background-color: white;
}

Однако это применится ко всем изображениям.