Puoi risolvere il problema se riesci ad accedere al server tramite SSH.
Ah. Quindi puoi accedere al server tramite SSH, quindi hai ancora il controllo. È un bene.
Probabilmente dovrai trovare un modo per risolvere quel problema.
Hai il controllo del DNS per il server? Se sì, puoi creare una nuova VM, eseguire il backup del sito esistente e trasferire i dati sul nuovo server. Vedi, ad esempio, Spostare un sito Discourse su un altro VPS con rsync.
Se non hai il controllo del DNS, il meglio che puoi fare sarebbe spostare il sito su un nuovo nome di dominio.