¿Cómo puedo obtener el mensaje "¿Instalar aplicación?" para mi Discourse?

Esto es incorrecto. «Native» se refiere a los banners de instalación para Android/iOS de DiscourseHub. Esto es la instalación de PWA para escritorio.

Esa opción está habilitada por defecto en cada instalación estándar de Discourse.

Eso no es una notificación y un sitio web no puede controlarlo. Aparecerá en la barra de direcciones cuando se visite un sitio compatible suficientes veces. Por el momento, solo Google Chrome y Microsoft Edge tienen esta función en el escritorio.