Как выбрать нужные светлую и темную палитры в пользовательской теме?

Да, с грядущей поддержкой светлых и тёмных палитр это будет легко реализовать. Как отмечает @Moin, подобное уже возможно, но это не самый интуитивный способ.

С предстоящими изменениями все палитры будут включать как светлый, так и тёмный режим в рамках самой палитры. Это касается как цветовых палитр, поставляемых с темами, так и тех, которые вы можете создавать и редактировать в админ-панели. Вы сможете при необходимости задавать значения по умолчанию.