Для этой конкретной перестройки вам нужно было загрузить новый базовый образ, что видно по строкам от WARNING до Status на вашем скриншоте. Он большой — 2,81 ГБ, согласно моей системе, поэтому то, что вы видите, — это место, потерянное из-за этой новой версии базового образа.
# docker images -a
REPOSITORY TAG IMAGE ID CREATED SIZE
discourse/base latest ab71a5d97460 4 days ago 2.81GB
Использование команды ./launcher cleanup очистит неиспользуемые контейнеры и образы, что может освободить достаточно места. Как отметил @pfaffman, прямая очистка (pruning) с помощью Docker также может удалить дополнительные неиспользуемые объекты, хотя лично я не заметил значительной пользы от этого помимо очистки контейнеров и образов.
Ещё один способ, который может помочь, — очистка кэша apt, который может стать довольно большим.
apt-get clean