Это может оказаться немного слишком пространным и специфичным для одного лишь этого параметра, чтобы внести изменения без проблем. 
Возможно, стоит создать тему в ux, чтобы обсудить, как сделать сообщения в стиле «применить значение по умолчанию для прошлых данных» более понятными и чётко указать, что они относятся только к значениям по умолчанию.
Я считаю, что это обоснованный #feature request. 
Я быстро поискал предыдущие обсуждения и нашёл вот это: Send only system emails when disable email setting is on, хотя, боюсь, оно тогда встретило довольно прохладную реакцию (хотя могут быть и другие, так как это обсуждение уже несколько лет назад). Лично я вижу смысл в такой опции.