Это может зависеть от операционной системы, но я использую Linux (Ubuntu), и здесь всё максимально просто. Справа в адресной строке у меня есть небольшой значок «+» (прямо перед иконкой «Избранное»). Нажмите на него, и установка произойдёт автоматически. После установки значок меняется на иконку «Открыть в Discourse Meta». Если я удалю PWA, значок «+» вернётся, чтобы можно было установить его снова.
Кроме того, если я открою меню Chrome во время просмотра Discourse Meta, там появится пункт «Установить Discourse Meta». После установки он меняется на «Открыть в Discourse Meta», а после удаления — снова на «Установить…».
Итак, один значок в адресной строке и один пункт в меню. По крайней мере, у меня именно так. Мне нечего больше добавить 
Вы вообще не обязаны полагаться на всплывающее сообщение.