Может быть, когда-нибудь появится опция в меню темы 
«Сортировать сообщения по дате»?
Таким образом, поведение по умолчанию останется прежним: сообщения будут добавляться в конец. Если администратор считает, что тему лучше оформить, встроив эти сообщения в старое обсуждение, достаточно будет быстро нажать на такую опцию при необходимости.