Я знаю, что это старый пост, но приведённая ниже рекомендация может быть полезна любым администраторам, которые хотят иметь чистый интерфейс, оставив при этом включённым режим Bootstrap на своём форуме Discourse.
Вы можете просто добавить следующее в раздел общих CSS-стилей вашей темы:
#global-notice-alert-bootstrap-mode {display:none!important;}