Zunächst einmal eine kurze Klarstellung:
Das ist nicht korrekt. Du verlierst deine Änderungen nicht beim Update, wenn sie in einem Theme vorgenommen wurden. Sie bleiben erhalten. Die einzige Möglichkeit, Änderungen zu verlieren, besteht darin, die Dateien direkt auf deinem Server zu bearbeiten, was du offensichtlich nicht tun solltest.
Allerdings ist mit dem Überschreiben von Vorlagen ein gewisses Risiko verbunden, da ein Update im Kern dazu führen kann, dass deine Änderungen nicht mehr kompatibel sind und aktualisiert werden müssen. Wenn du mit diesem Risiko einverstanden bist, kannst du technisch gesehen das erreichen, wonach du hier fragst.
Zunächst musst du eine Möglichkeit finden, zu unterscheiden, wann sich der Benutzer auf der Startseite befindet. Im Fall der reinen Kategorien-Komponente ist eine Möglichkeit, den searchContext zu überprüfen. Wenn du dich auf einer Unterkategorien-Seite befindest, ist der Suchkontext auf „category