Если основным сценарием использования являются файлы .md и общий язык, я всё же считаю, что у Discourse есть большое преимущество: это разговорная платформа, которая позволяет людям действительно общаться друг с другом на понятном языке. Как вы и сказали, именно такие обсуждения знаний должны происходить на Discourse. Поэтому, на мой взгляд, стоит подумать о том, как оставить большую часть этого контента именно там, иначе вы отвлечёте внимание и фокус от того, что должно стать вашей основной платформой.
Я могу представить себе такую схему:
- Readme.md как тема вики на Discourse, синхронизированная с GitHub;
- Обсуждение этого Readme в виде последующих постов на Discourse, которые регулярно удаляются (по аналогии с текущей настройкой на meta);
- Дополнительные файлы и папки в репозитории обрабатываются на GitHub с использованием ветвления. Текущая структура репозитория может синхронизироваться с Discourse, чтобы отображаться вместе с постом вики в виде оглавления.