Вы не запускаете миграции внутри плагина.
В среде разработки их выполняют из консоли.
Почему? Потому что при развертывании плагина миграции берет на себя основное приложение.
Это выходит за рамки того, что должен делать плагин.
(К сведению: это не означает, что вы не должны включать миграции в плагин, например, если вы изменяете базу данных, но сам плагин не будет выполнять эти миграции)