Настройки сайта reply_by_email_enabled и reply_by_email_address не отображаются в разделе «Администрирование» → «Настройки электронной почты». curiously, настройка alternative_reply_by_email_addresses отображается.
Кажется, в файле site_settings.yml отсутствует ключ area, хотя непонятно, почему они всё же появляются в разделе «Администрирование» → «Все настройки сайта» → «Электронная почта».