Странно, я не нашел никакой темы на эту тему, но это уже давно существующая небольшая проблема.
Здесь я определил пользовательский размер 50×20 для квадратного эмодзи:

Результат в предпросмотре маркдаун-редактора:

Результат в публикации выглядит как ожидалось:

Кроме того, изображения, которым в маркдаун-редакторе заданы пользовательские высота и ширина, игнорируют эти атрибуты при переключении на редактор в режиме rich markdown:

Однако после публикации всё выглядит как ожидалось.