Только заметил, что класс .results ещё не использует новые переменные цветов. Поэтому в тёмной теме фон результатов поиска всё ещё #ffffff.
Не могли бы вы добавить новые переменные в следующем обновлении?
Тем временем, если у кого-то возникла та же проблема, вот моё временное решение:
/* временное решение для фона баннера поиска */
.custom-search-banner-wrap .results {
background: var(--secondary)!important;
border: 1px solid var(--primary-low);
}