Почему порядок тем внутри категории отличается от порядка тем вне категорий?
Какой макет категории вы используете? (в настройках сайта desktop category page style). Некоторые макеты страниц категорий отображают топ-темы или избранные темы вместо тем с наибольшей недавней активностью.