Я не совсем понял, о чём вы говорите. Какой квадратный логотип? На вашем скриншоте я не вижу никакого логотипа? Вы спрашиваете, как добавить логотип?
Было бы полезно, если бы вы потратили немного больше времени на оформление создаваемых тем, подробнее описывая, что именно вы хотите получить, чтобы другие могли вам лучше помочь.
Общая ширина боковой панели определяется переменной --d-sidebar-width, так что вы можете попробовать уменьшить это значение.
Меня интересует, какой у вас план для страниц, отличных от главной, например, для страницы темы, как эта? Вы хотите оставить заголовок на этих страницах и «опустить» его только на главной? Макет, демонстрирующий вашу идею, был бы очень полезен.