allow duplicate topic titles の設定を変更してみてはどうでしょうか。
また、メールが1通で、2つのカテゴリに「受信者」がいる場合、unique posts mins も減らす必要があるかもしれません。
これらを試してみて、改善されるか確認してみてください。
しかし、このトピックの下部にある「関連トピック」をいくつかクリックしてみたところ、昨年この問題を試した人があまり進展を得られなかったようです。
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