В зависимости от того, что вам нужно изменить, я считаю, что лучшим решением будет использование PluginOutlet для внедрения вашего собственного кода или PluginOutlet Wrapper для замены или условного отображения базовой реализации. (Вы можете отправить PR для добавления outlet, если его нет.)
Если вы действительно хотите использовать modifyClass, это всё ещё возможно. Просто теперь модальное окно является компонентом и вложено в components/modal, поэтому обращаться к нему нужно так:
api.modifyClass("component:modal/poll-ui-builder", {
pluginId: "your-custom-plugin-id",
// вставьте свой код
});