Acho que a HostGator não oferece um servidor completo, então você precisaria mudar de hospedagem para fazer uma instalação em subpasta (na verdade, acho que talvez seja possível fazer uma instalação em subpasta com o Cloudflare na frente, mas não sei se alguém já fez isso).
Instalações em subpasta não são recomendadas e parece que poucas pessoas ainda acreditam que há uma vantagem em SEO, mas se você quiser fazer isso, veja Serve Discourse from a subfolder (path prefix) instead of a subdomain