私は15日前に同じ手順を実行しました。
cd /var/discourse
./launcher enter app
"/shared/letsencrypt"/acme.sh --cron --home "/shared/letsencrypt" --force
exit
まず学んだのは、Chromeで証明書を表示すると実際には有効であっても無効と表示される場合があることです。詳しくは以下をご覧ください：Chrome / Chromium のバグ：SSL 証明書の日付が正しく表示されない（期限切れと誤表示）
その後、以下を試みました
me@site:/var/discourse$ sudo ./launcher rebuild app
しかし、これは機能しませんでした。最後に以下を実行しました
sudo reboot
その結果、サイトは期待通りに動作するようになりました。
rebuild の手順について言及していますが、それが本当に必要かどうかは確信がありません。ただ、その過程で私が実行した手順の一つでした。