Для синхронизации групп между WooCommerce и Discourse требуется некоторый пользовательский код. Плагин WP Discourse не сделает это самостоятельно. Скорее всего, у вас уже есть реализация функций, описанных здесь:
Прежде чем я смогу помочь вам дальше, необходимо определить, как именно происходит синхронизация (это не только плагин WP Discourse).