Cloudflare が自動的にできることはあまりないと思います。Rocket Loader を CSP で許可するための手順はあります。ただし、Discourse の JavaScript はすでに十分に最適化されているため、Rocket Loader は必須ではありません。
Cloudflare の設定画面に行けば、Rocket Loader を個別に無効化できるはずです。その後、プロキシを再度有効にすると、CSP エラーは消えるでしょう。
多くのユーザーにとっては Cloudflare を完全に無効化する方が簡単ですが、DDoS 保護が本当に必要な場合は、以下の手順で設定できます：Full site CDN acceleration for Discourse