Vas a necesitar actualizar tu app.yml y reconstruir para obtener el verdadero beneficio de esas actualizaciones.
db_shared_buffers debería ser el 25% de la memoria de tu sistema, lo que equivaldría a 512 MB. Tu configuración actual probablemente sea de 256 MB.
unicorn_workers es dos por núcleo, así que cámbialo de 2 a 4.