Да. У вас Ubuntu как операционная система, затем Docker как приложение, установленное в ОС, и Discourse работает поверх Docker.
Docker позволяет изолировать приложения в контейнерах (упрощённо говоря, это лёгкие виртуальные машины), где можно запускать несколько приложений, не нарушая работу ОС.