Как человек, который тратит огромное количество времени на поддержку новичков-системных администраторов, я считаю, что это значительно увеличивает сложность. Поддержка даже одной предельно простой и безошибочной конфигурации требует колоссальных усилий. Даже управление установкой из двух контейнеров и знание того, что нужно заменить app на web_only (не говоря уже о том, чтобы знать, как и когда обновлять контейнер с данными), увеличивает сложность как минимум в четыре раза.
Это, я считаю, главное преимущество.