В настоящее время стандартный синтаксис Markdown в Discourse не соответствует GFM (для обоих основных провайдеров хостинга на основе Git для проектов с открытым исходным кодом), причем основным недостающим элементом являются сноски. Было бы разумно привести поддерживаемый синтаксис в соответствие с GFM.
Просто хочу убедиться, что вы понимаете: пользователи с самостоятельным размещением могут установить его бесплатно.
Ваш аргумент о переносе этой функции в ядро кажется мне разумным. Возможно, ваш довод о том, что «все ваши друзья по Markdown так делают», окажется убедительным!
Я администрирую экземпляр Discourse в академическом контексте (здесь) и настоятельно рекомендую сделать сноски стандартной функцией по умолчанию. Возможно, с настройкой сайта для администраторов, позволяющей при необходимости отключать эту функцию.